The DNMT1 associated lncRNA Dali is an epigenetic regulator of neural differentiation

Muchos loci intergénicos de ARN no codificante largo (lncRNA) regulan la expresión de genes de codificación de proteínas adyacentes. Menos claro es si los lncRNA intergénicos comúnmente regulan la transcripción modulando la cromatina en loci genómicamente distantes. Aquí, informamos los roles dependientes de ARN distales y genómicamente locales de Dali, un ARNt intergénico expresado del sistema nervioso central conservado. Dali se transcribe corriente abajo del gen del factor de transcripción Pou3f3 y su agotamiento altera la diferenciación de las células de neuroblastoma. Localmente, la transcripción de Dali regula la transcripción del locus Pou3f3. Distalmente, se dirige preferentemente a promotores activos y regula la expresión de genes de diferenciación neural, en parte a través de la asociación física con la proteína POU3F3. Dali interactúa con la metiltransferasa de ADN DNMT1 en ratones y humanos y regula el estado de metilación del ADN de los promotores asociados a la isla CpG en trans. Estos resultados demuestran, por primera vez, que un solo lncRNA intergénico controla la actividad y la metilación de elementos reguladores genómicamente distales para modular programas transcripcionales a gran escala.